Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SHBGP04278 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHBGP04278 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHBGP04278 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHBGP04278 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHBGP04278 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHBGP04278 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHBGP04278 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHBGP04278 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHBGP04278 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHBGP04278 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHBGP04278 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHBGP04278 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHBGP04278 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHBGP04278 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHBGP04278 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHBGP04278 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHBGP04278 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHBGP04278 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHBGP04278 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHBGP04278 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHBGP04278 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHBGP04278 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHBGP04278 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHBGP04278 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHBGP04278 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHBGP04278 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHBGP04278 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHBGP04278 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHBGP04278 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHBGP04278 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SHBGP04278 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHBGP04278 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHBGP04278 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHBGP04278 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHBGP04278 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHBGP04278 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHBGP04278 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHBGP04278 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHBGP04278 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHBGP04278 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHBGP04278 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHBGP04278 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHBGP04278 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHBGP04278 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHBGP04278 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHBGP04278 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHBGP04278 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHBGP04278 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHBGP04278 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHBGP04278 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHBGP04278 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHBGP04278 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHBGP04278 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHBGP04278 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHBGP04278 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHBGP04278 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SHBGP04278 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHBGP04278 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHBGP04278 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHBGP04278 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHBGP04278 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHBGP04278 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHBGP04278 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHBGP04278 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHBGP04278 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHBGP04278 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHBGP04278 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHBGP04278 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHBGP04278 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHBGP04278 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHBGP04278 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHBGP04278 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHBGP04278 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHBGP04278 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHBGP04278 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHBGP04278 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHBGP04278 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHBGP04278 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHBGP04278 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHBGP04278 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHBGP04278 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHBGP04278 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHBGP04278 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHBGP04278 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHBGP04278 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SHBGP04278 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHBGP04278 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHBGP04278 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHBGP04278 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHBGP04278 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHBGP04278 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SHBGP04278 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHBGP04278 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SHBGP04278 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHBGP04278 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHBGP04278 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHBGP04278 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHBGP04278 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHBGP04278 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms