Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.14■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.14■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
POLR1AO95602 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR1AO95602 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms