Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNDBP1O95273 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNDBP1O95273 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms