Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOBTB3O94955 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOBTB3O94955 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms