Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD2O60548 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms