Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL4O60488 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms