Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOBOXO60393 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOBOXO60393 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms