Protein–RNA interactions for Protein: O43929

ORC4, Origin recognition complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC4O43929 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ORC4O43929 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ORC4O43929 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ORC4O43929 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ORC4O43929 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ORC4O43929 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ORC4O43929 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ORC4O43929 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ORC4O43929 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ORC4O43929 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ORC4O43929 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ORC4O43929 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ORC4O43929 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ORC4O43929 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ORC4O43929 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ORC4O43929 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ORC4O43929 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ORC4O43929 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ORC4O43929 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ORC4O43929 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ORC4O43929 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ORC4O43929 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ORC4O43929 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ORC4O43929 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ORC4O43929 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ORC4O43929 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ORC4O43929 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ORC4O43929 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ORC4O43929 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ORC4O43929 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ORC4O43929 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ORC4O43929 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ORC4O43929 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ORC4O43929 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ORC4O43929 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ORC4O43929 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ORC4O43929 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ORC4O43929 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ORC4O43929 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ORC4O43929 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ORC4O43929 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ORC4O43929 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ORC4O43929 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ORC4O43929 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ORC4O43929 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ORC4O43929 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ORC4O43929 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ORC4O43929 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ORC4O43929 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ORC4O43929 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ORC4O43929 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ORC4O43929 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ORC4O43929 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ORC4O43929 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ORC4O43929 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ORC4O43929 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ORC4O43929 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ORC4O43929 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ORC4O43929 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ORC4O43929 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ORC4O43929 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ORC4O43929 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ORC4O43929 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ORC4O43929 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ORC4O43929 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ORC4O43929 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ORC4O43929 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ORC4O43929 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ORC4O43929 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ORC4O43929 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ORC4O43929 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ORC4O43929 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ORC4O43929 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ORC4O43929 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ORC4O43929 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ORC4O43929 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ORC4O43929 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ORC4O43929 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ORC4O43929 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ORC4O43929 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ORC4O43929 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ORC4O43929 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ORC4O43929 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ORC4O43929 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ORC4O43929 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ORC4O43929 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ORC4O43929 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ORC4O43929 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ORC4O43929 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ORC4O43929 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ORC4O43929 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ORC4O43929 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ORC4O43929 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ORC4O43929 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ORC4O43929 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ORC4O43929 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ORC4O43929 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ORC4O43929 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ORC4O43929 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ORC4O43929 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms