Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFDO43915 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFDO43915 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms