Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8B1O43520 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP8B1O43520 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms