Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRODHO43272 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRODHO43272 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRODHO43272 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRODHO43272 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRODHO43272 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRODHO43272 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRODHO43272 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRODHO43272 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRODHO43272 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRODHO43272 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRODHO43272 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRODHO43272 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRODHO43272 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRODHO43272 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRODHO43272 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRODHO43272 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRODHO43272 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRODHO43272 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRODHO43272 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRODHO43272 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRODHO43272 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRODHO43272 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRODHO43272 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRODHO43272 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRODHO43272 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRODHO43272 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRODHO43272 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRODHO43272 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRODHO43272 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRODHO43272 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRODHO43272 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRODHO43272 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRODHO43272 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRODHO43272 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRODHO43272 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRODHO43272 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRODHO43272 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRODHO43272 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRODHO43272 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRODHO43272 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRODHO43272 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRODHO43272 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRODHO43272 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRODHO43272 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRODHO43272 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PRODHO43272 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRODHO43272 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRODHO43272 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRODHO43272 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRODHO43272 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRODHO43272 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRODHO43272 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRODHO43272 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRODHO43272 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRODHO43272 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRODHO43272 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRODHO43272 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRODHO43272 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRODHO43272 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRODHO43272 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRODHO43272 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRODHO43272 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRODHO43272 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRODHO43272 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRODHO43272 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRODHO43272 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRODHO43272 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRODHO43272 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms