Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01565O15544 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01565O15544 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms