Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN6O15212 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN6O15212 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN6O15212 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms