Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD28O15084 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD28O15084 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms