Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms