Protein–RNA interactions for Protein: O00625

PIR, Pirin, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIRO00625 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIRO00625 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIRO00625 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIRO00625 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIRO00625 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIRO00625 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIRO00625 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIRO00625 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIRO00625 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIRO00625 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIRO00625 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIRO00625 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIRO00625 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIRO00625 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIRO00625 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIRO00625 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIRO00625 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIRO00625 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIRO00625 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIRO00625 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIRO00625 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIRO00625 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PIRO00625 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIRO00625 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIRO00625 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIRO00625 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIRO00625 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIRO00625 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIRO00625 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIRO00625 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIRO00625 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PIRO00625 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIRO00625 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIRO00625 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIRO00625 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIRO00625 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PIRO00625 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIRO00625 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIRO00625 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIRO00625 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIRO00625 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIRO00625 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIRO00625 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIRO00625 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIRO00625 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIRO00625 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PIRO00625 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIRO00625 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIRO00625 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIRO00625 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PIRO00625 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIRO00625 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIRO00625 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIRO00625 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PIRO00625 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIRO00625 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIRO00625 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIRO00625 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIRO00625 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIRO00625 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIRO00625 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIRO00625 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIRO00625 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIRO00625 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIRO00625 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIRO00625 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIRO00625 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIRO00625 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIRO00625 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIRO00625 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIRO00625 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIRO00625 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIRO00625 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIRO00625 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIRO00625 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIRO00625 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIRO00625 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIRO00625 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIRO00625 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PIRO00625 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIRO00625 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIRO00625 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PIRO00625 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIRO00625 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIRO00625 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIRO00625 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PIRO00625 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PIRO00625 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PIRO00625 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIRO00625 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIRO00625 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIRO00625 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIRO00625 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PIRO00625 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIRO00625 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIRO00625 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIRO00625 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIRO00625 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIRO00625 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIRO00625 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms