Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8SH3BPF8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms