Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF26H0Y7S4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF26H0Y7S4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms