Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms