Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-2B6SEH9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-2B6SEH9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms