Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMTNL1A8MU46 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMTNL1A8MU46 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms