Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF839A8K0R7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms