Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCNX2A6NKB5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCNX2A6NKB5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 519.3 ms