Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN8A6NHC0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms