Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23AA6NH52 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms