Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms