Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms