Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VWA3AA6NCI4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWA3AA6NCI4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms