Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms