Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTAGE9A4FU28 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTAGE9A4FU28 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CTAGE9A4FU28 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms