Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC162PA2VCL2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC162PA2VCL2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC162PA2VCL2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms