Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRBC2A0A5B9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBC2A0A5B9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBC2A0A5B9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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