Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms