Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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