Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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