Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms