Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms