Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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ATG4DQ86TL0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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ATG4DQ86TL0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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ATG4DQ86TL0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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ATG4DQ86TL0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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ATG4DQ86TL0 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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ATG4DQ86TL0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATG4DQ86TL0 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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