Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NESP48681 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NESP48681 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NESP48681 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NESP48681 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NESP48681 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NESP48681 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NESP48681 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NESP48681 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NESP48681 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NESP48681 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NESP48681 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NESP48681 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NESP48681 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NESP48681 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NESP48681 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NESP48681 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NESP48681 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NESP48681 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NESP48681 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NESP48681 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NESP48681 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NESP48681 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NESP48681 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NESP48681 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms