Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms