Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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