Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRKCHP24723 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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