Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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