Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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