Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms