Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP2AP11388 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms