Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GZMBP10144 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GZMBP10144 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
GZMBP10144 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
GZMBP10144 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GZMBP10144 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms