Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTAGE9A4FU28 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms