Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms