Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms